琥珀酰化修饰组学
琥珀酰化(Succinylation)是指琥珀酰基供体通过酶学等方式将琥珀酰基团共价结合到赖氨酸残基的过程。
琥珀酰化普遍存在于生物中,特别是中心代谢和中间代谢的很多代谢酶都存在琥珀酰化修饰,官方的参与代谢调节、表观调控、信号传导等众多生物学过程,与炎症、代谢疾病、肿瘤等疾病密切相关。
相比于甲基化和乙酰化,琥珀酰化修饰能够引发更多蛋白质特性的改变。这是由于发生琥珀酰化的赖氨酸基团被赋予2个负电荷,价态从+1变成-1,高于乙酰化(+1到0)和单甲基化(无变化)造成的电荷改变;而且琥珀酰化带来了一个结构更大的基团,对于蛋白质结构和功能能改变更大。
技术原理
首先将蛋白样本酶解成肽段混合物,然后使用液相色谱对酶解后的肽段混合物进行组分分离以降低样本复杂程度,然后通过高质量的琥珀酰化修饰类抗体和生物材料对修饰肽段进行富集,最后上样至液相色谱-串联质谱中进行分析定量。
参考文献
Sadhukhan, et al., 2016, Metabolomics-assisted proteomics identifies succinylation and SIRT5 as important regulators of cardiac function. Proceedings of the National Academy of Sciences .