TMT/iTRAQ标记定量蛋白质组学

iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags)技术是分别由美国AB Sciex公司和Thermo公司研发的多肽体外标记定量技术。此类技术最多可采用11种稳定同位素标签，通过特异性标记多肽的氨基基团，然后进行串联质谱分析，可同时比较多达10种不同样本中蛋白质的相对含量。

技术原理

iTRAQ/TMT试剂由三部分组成：报告基团、平衡基团和反应基团。反应基团形成2-10种等质量同位素标签。iTRAQ/TMT试剂标记酶解后的肽段，可与氨基酸N端及侧链的伯胺基团发生反应。在一级谱图中，来自于不同样本的同一肽段，标记后表现为相同的质荷比。在二级谱图中，报告基团、平衡基团和反应基团之间的键断裂，带不同同位素标签的同一肽段产生质量不同的报告离子，根据报告离子的丰度可获得样本间相同肽段的定量信息，再经过软件处理得到蛋白质的定量信息。其基本原理与技术流程如下图所示：

技术优势

平行比较2-10个样本

蛋白深度深，覆盖度高

可用于各种类型的样本

参考文献

[1] Yang QS, Wu JH, et al. Quantitative proteomic analysis reveals that antioxidation mechanisms contribute to cold tolerance in plantain (Musa paradisiacal L.; ABB Group) seedlings. Mol Cell Proteomics. 2012; 11(12): 1853-69.

[2] Leivonen SK, Rokka A, et al. Identification of miR-193b targets in breast cancer cell and systems biological analysis of their functional impact. Mol Cell Proteomics.2011; 10(7).

[3] Xu C, Gao X, et al. The basal level ethylene response is important to the wall and endomembrane structure in the hypocotyl cells of etiolated arabidopsis seedlings. Mol Cell Proteomics. 2012; 54(7): 434-55.