Label free定量蛋白质组学

非标记(Label-free)蛋白质组定量技术是一种不依赖于同位素标记的新型蛋白质定量技术，该技术通过液质联用对蛋白质酶解肽段进行分析，无需昂贵的稳定同位素标签做内部标准，只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据，比较不同样本中相应肽段的信号强度，就能对相应的蛋白质进行相对定量。

技术原理

现有基于质谱的非标记定量技术主要有两种：一种是依据一级质谱相关的肽段峰强度(peak intensity)和峰面积(peak area)等信息进行蛋白定量，另一种是依据蛋白质对应肽段的二级质谱总数(spectral counts)进行定量。

技术优势

无需同位素标记，从而使样本接近最原始对状态。

不受样本条件对限制，克服了标记定量技术在对多个样本进行定量方面对缺陷。

参考文献

[1] Niemann M, Wiese S, et al. Mitochondrial outer membrane proteome of Trypanosomabrucei reveals novel factors required to maintain mitochondrial morphology. Mol Cell Proteomics. 2013; 12(2): 515-28.

[2] Vanderschuren H, Nyaboga E, et al. Large-Scale Proteomics of the Cassava Storage Root and Identification of a Target Gene to Reduce Postharvest Deterioration. Plant Cell. 2014.

[3] Cholewa BD, Pellitteri-Hahn MC, et al. Large-Scale Label-Free Comparative Proteomics Analysis of Polo-Like Kinase 1 Inhibition via the Small-Molecule Inhibitor BI 6727 (Volasertib) in BRAFV600E Mutant Melanoma Cells. J Proteome Res. 2014 Jun 9.