定量蛋白质组
定量蛋白质组是指对特定已知蛋白质进行质谱检测,而不会像发现蛋白质组那样对所有未知蛋白进行全检测。
定量蛋白质组学是一种用来检测样品中蛋白相对/绝对含量的分析化学技术,而质谱则是实现该技术依赖的一个重要手段。基于质谱的蛋白质组学主要分为两大类,即标记定量和非标记定量。其中,标记定量包括SILAC、iTRAQ和TMT,由于SILAC只能针对可以传代培养的细胞进行标记,所以不常用。常用的是iTRAQ和TMT两种方法,其均是利用质谱检测报告离子的信号相应强度来对蛋白进行相对定量的。而非标记定量包括lable free和DIA。Lable free原理是对被检测到的离子峰强度进行积分,以积分面积进行相对定量的。DIA方式则是传统非标记定量的升级版,能够扫描到更全面地碎片信息,不会造成低丰度蛋白的丢失。
蛋白质组学平台拥有Q Exactive、Orbitrap fusion lumos、Tims TOF Pro、Orbitrap Exploris 480等多种不同类型的质谱。