焦磷酸测序(Pyrosequencing)
焦磷酸测序技术(Pyrosequencing)作为一种新的序列分析技术,能够快速地检测甲基化的频率,对样品中的甲基化位点进行定性及定量检测,为甲基化研究提供了新的途径。我公司提供基于QIAGEN公司焦磷酸测序平台的服务。
焦磷酸测序技术原理
焦磷酸测序技术是由4种酶(DNA 聚合酶、ATP硫酸化酶、荧光素酶和三磷酸腺苷双磷酸酶)催化的同一反应体系中的酶级联化学发光反应。
具体过程如下:
1. 仪器向待检测样品中每次只加入一个核苷酸碱基(dNTP) ;
2. 互补的碱基结合在模板上时,会释放出焦磷酸基团Pyrophosphate (PPi) ;
3. PPi在ATP硫酸化酶(ATP Sulfurylase)作用下,合成ATP,ATP作为能量分子,驱动荧光素在荧光素酶(Luciferase)的催化下转化为氧化荧光素,并发出与ATP能量成正比的荧光信号 ;
4. 信号被CCD数码相机捕捉,形成峰形PyrogramTM;
5. 未与模板结合的碱基将被三磷酸腺苷双磷酸酶(Apyrase)降解 ;
6. 加入下一种dNTP。
焦磷酸测序实验流程
焦磷酸测序在DNA甲基化中的应用
2 基因组整体水平的甲基化检测
2 特异位点的甲基化检测
2 寻找新的甲基化位点
焦磷酸测序结果展示
技术优势
1.先进的算法设计可优化最佳的实验条件,内嵌式的质控保证数据的准确可靠,全程的软件控制减少人为因素的影响;
2.灵敏度高,可测到邻近CpG区域的单个甲基化水平,甚至包括测序的引物区域;
3.周期短、通量高,1h内可同时平行分析96个样本,一次运行可实现多个连续CpG位点定量分析;
4.除常规的检测位点变化情况外,还可准确计算频率变化;
5.对于检测位点要求低,可检测未知序列信息,覆盖到人类基因组的所有CpG位点;
6.对于样品要求低,适用于新鲜、冷冻和FFPE样本。