宏基因组测序

技术介绍

宏基因组测序是对特定环境中的整个微生物群落的基因组信息进行检测，进而研究生境中微生物的群落结构、物种分类、进化关系、基因功能及微生物与生境之间的相互作用关系的一项测序技术。宏基因组测序不依赖传统的微生物分离纯化技术，直接提取生境样本中的总 DNA 进行测序，为鉴定低丰度的微生物群落和获得更多新基因等提供了新的途径。

实验流程

分析流程

技术优点

1. 宏基因组不依赖于微生物的分离培养，克服了传统的纯培养方法的技术限制，为研究和开发利用占微生物种类99%以上的未可培养的微生物提供了一种新的途径和良好的策略；

2. 可以得到环境中丰度较低的，甚至是痕量微生物的信息，为研究低丰度微生物提供了途径；

3. 宏基因组学引入了宏观生态的研究理念，对环境中微生物菌群的多样性、功能活性等宏观特征进行研究，可以更准确地反应出微生物生存的真实状态。

样本要求

环境及临床样本（干冰或冰袋运送）

土壤≥ 10 g（污染土壤样本要适当增加送样量，20g）；粪便≥ 2g；

水体样本：滤膜（滤膜直径 3-4 cm）；拭子样本≥ 2 个；

DNA（干冰或冰袋运送）

DNA：浓度≥ 50 ng/μL；总量≥ 2 μg；DNA 要有明显主带，无降解，OD260/280= 1.8-2.0