全外显子组测序
技术简介
全外显子组测序(Whole Exome Sequencing,WES)是对整个基因组的全部基因编码区进行测序。人类基因组大小约 3G 个碱基,而基因编码区只占 1 -2%,大约 30M 个碱基。而编码区出现的变异往往会导致严重的后果,是大多数遗传病或肿瘤发生的直接原因。因此,对外显子区域进行测序是最为经济有效的方法之一。
技术原理
全外显子组测序利用 Agilent SureSelect 捕获探针杂交富集外显子区域的 DNA 序列,结合高通量测序,可以发现外显子区域相关变异信息。
仪器平台
Illumina 高通量测序平台
技术应用
发现外显子区域的突变,寻找突变与遗传病、复杂疾病、肿瘤等疾病的关系。
项目流程
样品要求
样本类型:DNA、组织、细胞、全血等;
DNA 总量:DNA≥ 2 μg;浓度:DNA≥ 50 ng/μl;要求主带清晰,无降解,浓度大于 50ng/ul,总量大于 1ug,OD260/OD280 =1.8~2.0,OD260/OD230=1.5 ~2.2。
测序深度:≥100X;
测序读长:2*150bp。